リモートセンシングによる樹高推定のフロー
LiDAR 点群データや複数ソースのリモートセンシング画像を使い、QGIS と Python を組み合わせて森林の樹高を推定する一連のフロー。
ツールの名前を紹介するだけではありません。ここでは、実際の研究場面から出発して、複数のツールをどう組み合わせて使うかを一連の操作の流れとして紹介します。
LiDAR 点群データや複数ソースのリモートセンシング画像を使い、QGIS と Python を組み合わせて森林の樹高を推定する一連のフロー。
地点データの準備から APSIM NG のトウモロコシモデルの実行まで行い、気候や管理措置が収量に与える影響を分析します。
元データから投稿品質の図までの標準化されたフローで、R/Python による作図と Inkscape での後処理をカバーします。
文献の収集、PDF の管理、読書ノートから、論文の下書き執筆、参考文献の挿入までの一連のフロー。
空間データの整理、投影法の統一から、主題図の作成、論文用のレイアウト出力までの GIS 地図作成のフロー。
Sentinel、Landsat、ドローン画像を対象とした、前処理、サンプル作成、分類、精度評価のフロー。
元の表から、論文の結果に使えるクリーニング、記述統計、有意性検定、図表の出力までのフロー。
スキャンした PDF、古い文献、アーカイブ資料を、検索・コピー・管理ができる文献ファイルに変換します。
顕微鏡画像、病害画像、粒子画像、組織切片を対象とした、セグメンテーション、計数、計測、統計のフロー。
ドローン写真から、オルソ画像、点群、DEM/DSM、基本的な地形・植生解析までのワークフロー。
キーワードの共起、文献の引用ネットワーク、種の相互作用ネットワーク、複雑な関係データのクリーニング、分析、可視化のためのフロー。
無料の LibreOffice Base と MySQL を使い、10〜20 人程度の小規模チーム向けに、簡単な日報の入力・検索システムを構築します。小さな会社、研究グループ、ラボ、プロジェクトチームが、紙の日報やばらばらの Excel ファイルを低コストで置き換えるのに向いています。
無料またはオープンソースのツールで個人の研究ホームページを構築し、自己紹介、研究テーマ、論文の成果、プロジェクトの説明、ツールのダウンロードを掲載します。研究者、博士課程の学生、研究グループのメンバー、フリーランスの研究支援者が、長期的に維持できる個人の発信の場を作るのに向いています。
スキャンした PDF、ダウンロードした文献、古い資料を Zotero の文献ライブラリに整理し、OCR とタグ体系によって検索、閲読、執筆の効率を高めます。
正式な投稿の前に、論文の本文、参考文献、図表、補足資料、PDF ファイルを体系的にチェックし、形式の誤りや手戻りを減らします。
一般の研究ユーザー向けに、Excel や LibreOffice の表から、データのクリーニング、統計解析、結果の書き出し、論文用の図表の整理までを行います。
論文、報告書、スキャン資料、プロジェクトファイルを一括で整理し、PDF の結合、分割、圧縮、命名、OCR、アーカイブを行います。
表データや実験データから、特徴量の整理、モデルの学習、パラメータ調整、検証、結果の解釈までを行う、研究の予測モデリングに向いたフロー。
病害の識別、顕微鏡画像の識別、物体検出、画像分類のタスク向けに、画像の整理、アノテーション、品質チェック、学習セットの分割を行います。
FASTQ のシーケンスデータを対象に、元データの整理、品質チェック、フィルタリング、アライメント前の準備、MultiQC レポートの集約を行います。
16S アンプリコンシーケンスのデータとサンプル情報表から、品質管理、特徴量テーブルの作成、多様性分析、差異分析、可視化を行います。
インタビュー記録、自由記述式アンケート、フィールドノート、テキスト資料の整理、匿名化、コーディング、テーマ分析、結果のまとめのためのフロー。
論文に関連するデータ、コード、説明ファイル、補足資料を整理してオープンサイエンスのプラットフォームに公開し、引用可能なリンクや DOI を取得します。
無料またはオープンソースのツールで、小規模な研究グループのファイル共有、タスクの割り振り、進捗の記録、会議資料、成果のアーカイブのフローを構築します。