微生物叢上級
マイクロバイオーム 16S データ解析のフロー
16S アンプリコンシーケンスのデータとサンプル情報表から、品質管理、特徴量テーブルの作成、多様性分析、差異分析、可視化を行います。
QIIME 2R / RStudio
1〜2 日 5 ステップワークフローを見る
アンプリコンシーケンスや群集解析に使える、オープンソースのマイクロバイオームデータ解析プラットフォーム。
QIIME 2 はオープンソースのマイクロバイオーム・バイオインフォマティクス解析プラットフォームで、16S、アンプリコンシーケンス、微生物群集の組成、多様性分析、再現可能なワークフロー管理によく使われます。生態、医学、農業、環境のマイクロバイオーム研究に向いています。
適用場面：マイクロバイオーム解析、16S アンプリコン、多様性分析、群集構造、再現可能なワークフロー
注意：QIIME 2 にはある程度のコマンドラインとバイオインフォマティクスの基礎が必要です。初心者は公式チュートリアルと併せて学ぶことをおすすめします。