mothur

mothur はオープンソースの微生物生態データ解析ソフトウェアで、16S rRNA アンプリコンデータ、OTU/ASV 解析、群集構造、多様性、微生物生態の統計解析によく使われます。

適用場面：微生物生態、16S、アンプリコンシーケンス、多様性解析、群集構造

注意：QIIME 2 と比較して選べます。具体的な手順はシーケンスプラットフォームと研究目的に合わせて決めてください。