BWA

BWA はよく使われるオープンソースの短鎖配列アラインメントツールで、シーケンスリードを参照ゲノムにマッピングします。ゲノムのリシーケンス、変異検出、集団遺伝学、シーケンスデータの前処理によく使われます。

適用場面：リードのマッピング、参照ゲノム、変異検出、NGS データ、バイオインフォマティクス

注意：通常は SAMtools、BCFtools、FastQC、MultiQC などのツールと組み合わせて使います。