バイオインフォマティクス中級
シーケンスデータの品質管理と結果集約のフロー
FASTQ のシーケンスデータを対象に、元データの整理、品質チェック、フィルタリング、アライメント前の準備、MultiQC レポートの集約を行います。
FastQCMultiQC
2〜6 時間 5 ステップワークフローを見る
FastQC やさまざまな解析ソフトの結果をまとめるオープンソースのバイオインフォマティクスレポート集約ツール。
MultiQC はオープンソースのレポート集約ツールで、複数のバイオインフォマティクスソフトの出力を読み取り、統一された HTML レポートを作成します。FastQC、STAR、Bowtie2、BWA、SAMtools などの結果をまとめるのによく使われます。
適用場面：品質管理レポートの集約、NGS のフロー、バイオインフォマティクスのレポート、多検体解析、HTML レポート
注意：MultiQC は個々の解析ソフトの代わりにはならず、主に結果の集約と確認に使います。