バイオインフォマティクス中級
シーケンスデータの品質管理と結果集約のフロー
FASTQ のシーケンスデータを対象に、元データの整理、品質チェック、フィルタリング、アライメント前の準備、MultiQC レポートの集約を行います。
FastQCMultiQC
2〜6 時間 5 ステップワークフローを見る
FASTQ ファイルの品質チェックとレポート作成に向いた、無料でオープンソースのシーケンスデータ品質管理ツール。
FastQC はよく使われるシーケンスデータの品質管理ツールで、FASTQ ファイルの塩基品質、GC 含量、アダプターの混入、重複配列などをチェックし、品質管理レポートを作成します。NGS データ解析前の基本的な品質チェックに向いています。
適用場面：シーケンスの品質管理、FASTQ、NGS、品質レポート、バイオインフォマティクス
注意：多検体のプロジェクトでは MultiQC でレポートをまとめることをおすすめします。