IGV

シーケンスのアライメント、変異、ゲノムアノテーションの閲覧に使える、無料・オープンソースのゲノムブラウザ。

詳しい紹介

IGV(Integrative Genomics Viewer)は無料・オープンソースのゲノムブラウザで、BAM、VCF、BED、GFF などのゲノムデータを閲覧でき、シーケンスのアライメント結果、変異箇所、遺伝子アノテーション、オミクスデータの可視化に向いています。

適用場面:ゲノム閲覧、シーケンスアライメント、変異の確認、BAM/VCF、遺伝子アノテーション

注意:IGV は閲覧・確認用のツールであり、変異検出や統計解析のフローの代わりにはなりません。