ParaAT

ParaAT はタンパク質コード DNA 配列向けの並列アライメントツールで、タンパク質のアライメント結果から対応するコドンのアライメントを生成でき、分子進化や選択圧の解析の前処理によく使われます。

適用場面：分子進化、配列解析、コドンアライメント、並列解析、Ka/Ks 解析の前処理

注意：このツールはバイオインフォマティクスとコマンドラインの基礎があるユーザー向けです。MEGA は無料の GUI ソフトとしてよく使われますが、単純にオープンソースとは表記しないことをおすすめします。