データ可視化中級
ネットワーク関係・ナレッジグラフの可視化フロー
キーワードの共起、文献の引用ネットワーク、種の相互作用ネットワーク、複雑な関係データのクリーニング、分析、可視化のためのフロー。
GephiCytoscape
2〜4 時間 5 ステップワークフローを見る
生物ネットワークやシステム生物学の解析によく使われる、オープンソースの複雑ネットワーク可視化プラットフォーム。
Cytoscape は複雑ネットワークを可視化し、ノード、エッジ、属性データを統合するためのオープンソースのプラットフォームです。当初は主に分子相互作用ネットワークや生物学的パスウェイの解析に使われていましたが、現在は一般的な複雑ネットワーク、意味ネットワーク、社会ネットワークの分析にも使えます。
適用場面：生物ネットワーク、遺伝子相互作用ネットワーク、生態ネットワーク、複雑な関係の可視化、ネットワークのアノテーション解析