Snakemake

Snakemake はオープンソースのワークフロー管理システムで、ルールによってデータ解析の工程、入出力、依存関係を記述し、自動化された、再現可能で拡張しやすい解析フローを実現できます。バイオインフォマティクス、リモートセンシング処理、モデルシミュレーション、研究データの一括解析によく使われます。

適用場面：研究フローの自動化、データ解析パイプライン、バイオインフォマティクス、一括処理、再現可能な研究

注意：ある程度の Python とコマンドラインの基礎が必要で、繰り返し行う解析フローの標準化に向いています。