細胞画像のハイスループット解析に向いた、Broad Institute 製の無料・オープンソースの画像解析ソフト。
CellProfiler は Broad Institute が開発した無料・オープンソースの画像解析ソフトで、主に生物医学や細胞画像の自動解析を対象としています。ビジュアルなパイプライン方式を採用しており、細胞の計数、蛍光の定量、形態計測、ハイスループットな表現型解析を一括で行うのに向いています。
適用場面：細胞画像の解析、顕微鏡画像の一括処理、蛍光の定量、ハイスループットな表現型解析
おすすめの組み合わせ：CellProfiler + ImageJ/Fiji + napari
